Locus 2734

Sequence ID 2L_DroMel_CAF1
Location 7,683,823 – 7,683,942
Length 119
Max. P 0.820112
window4347

overview

Window 7

Location 7,683,823 – 7,683,942
Length 119
Sequences 6
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 75.34
Mean single sequence MFE -52.67
Consensus MFE -21.38
Energy contribution -22.11
Covariance contribution 0.73
Combinations/Pair 1.47
Mean z-score -2.24
Structure conservation index 0.41
SVM decision value 0.68
SVM RNA-class probability 0.820112
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>2L_DroMel_CAF1 7683823 119 - 22407834
UUGUUCGGAUCUUUUCCAGUCCCAGCCU-GAUUCGCUACUAGAGGCGGGUCUGGUUGACAAUCUUCCUAGGCGCCGCCUCGUAAUAGUUGACCGGGCGGGAAAGGAGCUUGGUGGGCACA
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>DroVir_CAF1 29424 117 - 1
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>DroGri_CAF1 37823 113 - 1
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>DroMoj_CAF1 31376 113 - 1
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>DroAna_CAF1 32543 116 - 1
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>DroPer_CAF1 30382 119 - 1
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>consensus
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alignment

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secondary structure

Postscript

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