Index of PCR products

Summary

Primer clones Hox seq. non-Hox empty
5E5/3F 33 29 3 1
5E52/3F 78 64 12 2
5E/3F 167 144 16 7
Total 278 238 30 10

 

Full list of PCR products

<<<>>> indicates non-Hox genes, empty clones are marked with ---.
Sequence names are given for the clones contained in the raw sequence data file, all other clones are shown only by their number in italics.
seq homeobox
5E5/3F
1 ---
H2.5E5T7 <<<>>>
H3.5E5T7 Hox10_Y1 rc
H4.5E5T7 Hox11_X
H5.5E5T7 Hox9_Z1
H6.5E5T7 Hox11_Z rc
H7.5E5T7 Hox9_Z1
H8.5E5T7 Hox11_Y
H9.5E5T7 Hox10_X
H10.5E5T7 Hox10_Y1
H11.5E5T7 Hox11_Z
H12.5E5T7 Hox10_Y1
13 Hox10_Z
H14.5E5T7 <<<>>>
H15.5E5T7 Hox10_Y1
H16.5E5T7 Hox11_X rc
H17.5E5T7 Hox10_Z
H185E5.T7 Hox11_X rc
19 Hox11_X
H205E5.T7 Hox10_Z rc
H215E5.T7 Hox9_Z1
H22.5E5.T7 Hox9_Z1 rc
H235E5.T7 Hox9_W
H24.5E5T7 Hox11_X rc
H25.5E5T7 Hox11_Z rc
H26.5E5T7 Hox9_Z1
H27.5E5T7 Hox10_Y2
H28.5E5T7 Hox11_X
H29.5E5T7 Hox11_Z rc
H30.5E5T7 Hox11_Z
H31.5E5T7 Hox11_Z
H32.5E5T7 Hox11_Z
33 <<<>>>
5E52/3F
H1.5E52.SP6 Hox11_Z rc
H2.5E52.SP6 Hox13_Z
H3.5E52.SP6 Hox13_Z
H4.5E52.SP6 Hox13_Y rc
H5.5E52.SP6 Hox9_W rc
H6.5E52.SP6 Hox10_X
H7.5E52.SP6 Hox13_Z
H8.5E52.SP6 <<<>>>
H9.5E52.SP6 Hox11_Y rc
H10.5E52SP6 Hox10_W
H11.5E52.SP6 Hox9_W rc
H12.5E52.SP6 Hox9_X
H13.5E52.SP6 Hox13_Y
H14.5E52.SP6 Hox10_Y1
H15.5E52.SP6 Hox9_Z1
H16.5E52.SP6 Hox10_W2
H17.5E52.T7 <<<>>>
H18.5E52.T7 Hox9_W
H19.5E52.T7 Hox11_Z rc
H20.5E52.T7 Hox13_Y
21 Hox10_W2
H22.5E52.SP6rc Hox9_Z4
23 Hox11_X
24 Hox13_Z
H25.5E52.T7 Hox13_Z
H26.5E52.T7 Hox10_Y1
H27.5E52.T7 Hox11_Z rc
H28.5E52.T7 Hox9_Z1
H29.5E52.T7 Hox13_Y rc
H30.5E52.T7 Hox9_X
H31.5E52.T7 Hox9_Y
H32.5E52.T7 Hox13_Y rc
H33.5E52.SP6 Hox9_Y
H34.5E52.SP6 Hox13_Y
H35.5E52.SP6 Hox13_Y rc
H36.5E52.SP6 Hox13_Y
H37.5E52.SP6 <<<>>>
38 Hox13_Z
39 Hox10_W2
40 Hox13_Z
41 Hox13_Y
42 Hox13_Y
43 Hox13_Y
44 Hox13_Z
45 Hox13_Y
46 <<<>>>
47 <<<>>>
48 <<<>>>
49 ---
50 Hox9_Z1
51 Hox10_W2
H52.5E52.SP6 <<<>>>
53 Hox13_Y
54 <<<>>>
55 Hox9_X
56 Hox13_Z
57 Hox13_Y
58 Hox10_W2
59 Hox13_Z
60 Hox11_Z
61 Hox13_Y
62 Hox13_Y
63 Hox13_Y
64 <<<>>>
65 <<<>>>
66 <<<>>>
67 Hox13_Z
68 Hox11_X
69 Hox13_Z
70 Hox13_Y
71 ---
72 Hox13_Z
73 Hox13_Y
74 Hox13_Z
75 <<<>>>
76 Hox13_Y
77 Hox9_W
78 Hox13_Z
5E/3F
H1.sp6 Hox1_Z
H2.sp6 Hox10_Z
H3.T7 Hox1_Y
H4.sp6 <<< GBX >>>
H5.T7 Hox10_Z
H6.T7 Hox1_X
H7.T7 HoxM_W
H8.T7 HoxM_Z2 rc
H9.T7 HoxM_Z4 =U1
H10.T7 HoxM_V
H11.T7 HoxM_V
H12.T7 Hox1_Y rc
13 ---
14 ---
H15.T7 <<< GBX >>>
H16.T7 Hox8_Z
H17.T7 <<< GBX >>>
H18.T7 Hox9_Z1
H19.T7 Hox9_Y =_Z5
H20.SP6 Hox9_Z1
H21.T7 Hox10_Z
H22.T7 HoxM_V
H23.T7 Hox8_Z
H24.T7 Hox10_Z
H25.T7 HoxM_Z2
H26.T7 <<<>>>
H27.T7 HoxM_Z1
H28.T7 HoxM_Y rc
H29.T7 HoxM_Z1 rc
H30.T7 Hox8_Z
H31.T7 Hox1_X rc
H32.T7 HoxM_Z4
H33.T7 HoxM_Z1
H34.T7 Hox8_Z
H35.T7 Hox1_X rc
H36.T7 <<<>>>
H37.SP6 HoxM_W
H38.T7 <<< GBX >>>
H39.T7 HoxM_V
H40.SP6 Hox9_Z1 rc
H41.T7 HoxM_Z1
H42.T7 HoxM_Z1 rc
H43.T7 Hox3_Z rc
H44.T7 Hox3_Z rc
H45.T7 Hox1_Y
H46.T7 HoxM_Z2
H47.T7 HoxM_Z4
H48.T7 <<< GBX >>>
H49.T7 Hox10_Z
H50.T7 HoxM_Z4
H51.T7 HoxM_Z4
H52.T7 HoxM_Z3 rc
H53.T7 Hox1_Z rc
H54.T7 Hox10_Z rc
H55.T7 Hox9_Z3 rc
H56.T7 Hox9_Z1 rc
H57.T7 Hox2_Z rc
H58.T7 HoxM_Z2
H59.T7 Hox9_Z1
H60.T7 Hox1_Y rc
H61.T7 <<< GBX >>>
H62.T7 Hox1_X
H63.T7 Hox1_Y
H64.T7 HoxM_Z3
H65.T7 Hox8_Z rc
H66.T7 Hox10_Z rc
H67.T7 Hox1_Z
H68.T7 Hox9_Z1 rc
H69.T7 Hox2_Z rc
H70.T7 Hox8_Z rc
H71.T7 Hox2_Z_1
H72.T7 Hox8_Z rc
H73.T7 HoxM_Z1 rc
H74.T7 Hox2_Z rc
H75.T7 Hox9_W rc
H76.T7 Hox1_Y
H77.T7 HoxM_V
H78.T7 Hox10_Z
H79.T7 Hox1_X
H80.T7 <<< GBX >>>
H81.T7 <<< GBX >>>
H82.T7 Hox10_Z rc
H83.T7 Hox9_V
H84.T7 Hox10_Z rc
H85.T7 HoxM_V rc
86 <<<>>>
H87.T7 Hox9_W rc
H88.T7 Hox9_Z1 rc
89 Hox1_X
90 Hox1_X
91 Hox9_Y
92 HoxM_V
93 Hox10_Z
94 Hox2_Z
95 HoxM_Z4
96 Hox2_Z
97 HoxM_V
98 Hox1_X
99 Hox2_Z
100 <<<>>>
101 Hox8_Z
102 Hox8_Z
H103EF.T7rc Hox3_Y
104 Hox10_Z
105 HoxM_Z4
106 Hox9_Z3
107 HoxM_V
108 ---
109 <<<>>>
110 Hox1_X
111 Hox9_Z3
112 HoxM_Z1
113 ---
114 Hox9_Z1
115 Hox1_Y
116 <<< GBX >>>
117 <<<>>>
118 HoxM_W
119 ---
120 HoxM_W
H121EF.T7 Hox8_W
122 Hox9_Y
123 HoxM_Z1
124 Hox10_Z
125 HoxM_Z1
126 Hox10_Z
127 HoxM_Z1
128 HoxM_Z1
H129EF.T7 Hox8_Y
130 HoxM_Z1
131 Hox1_X
132 Hox1_X
133 Hox8_W
134 HoxM_Z2
135 Hox10_Z
136 HoxM_Z4
137 Hox9_Z3
138 ---
139 Hox10_Z
140 ---
141 Hox8_Y
H142EF.T7rc HoxM_U2
143 Hox9_Z1
144 Hox2_Z
145 Hox8_Z
146 Hox1_X
H147EF.T7 Hox8_X
148 Hox8_Z
149 Hox1_X
150 HoxM_Z2
151 Hox9_Z3
152 Hox10_Z
153 <<<>>>
154 HoxM_U2
155 Hox2_Z
156 HoxM_Z4
157 Hox10_Z
158 Hox8_W
159 Hox1_X
160 Hox8_X
161 Hox2_Z
162 Hox9_Z1
163 Hox9_Z1
164 HoxM_Y
165 Hox8_Y
166 Hox9_Z1
167 Hox3_Z