Pairwise Hamming Distances

length = 81
threshold = 11

distance	Hox1_Z	Hox1_Y	Hox1_X
Hox1_Z	0	15	21
Hox1_Y	15	0	20
Hox1_X	21	20	0
relative
Hox1_Z	0.000	0.185	0.259
Hox1_Y	0.185	0.000	0.247
Hox1_X	0.259	0.247	0.000

length = 81
threshold = 12

length = 81
threshold = 7

length = 81
threshold = 6 ... 11

distance	HoxM_Z1	HoxM_X	HoxM_Z3	HoxM_Z2	HoxM_Z4	HoxM_U1	HoxM_Y	HoxM_W	HoxM_U2	HoxM_V
HoxM_Z1	0	2	8	7	18	18	15	19	17	24
HoxM_X	2	0	10	9	20	20	16	19	17	24
HoxM_Z3	8	10	0	7	15	15	15	20	19	27
HoxM_Z2	7	9	7	0	16	17	13	15	15	26
HoxM_Z4	18	20	15	16	0	2	12	16	17	22
HoxM_U1	18	20	15	17	2	0	13	17	18	24
HoxM_Y	15	16	15	13	12	13	0	12	12	25
HoxM_W	19	19	20	15	16	17	12	0	12	21
HoxM_U2	17	17	19	15	17	18	12	12	0	22
HoxM_V	24	24	27	26	22	24	25	21	22	0
relative
HoxM_Z1	0.000	0.025	0.099	0.086	0.222	0.222	0.185	0.235	0.210	0.296
HoxM_X	0.025	0.000	0.123	0.111	0.247	0.247	0.198	0.235	0.210	0.296
HoxM_Z3	0.099	0.123	0.000	0.086	0.185	0.185	0.185	0.247	0.235	0.333
HoxM_Z2	0.086	0.111	0.086	0.000	0.198	0.210	0.160	0.185	0.185	0.321
HoxM_Z4	0.222	0.247	0.185	0.198	0.000	0.025	0.148	0.198	0.210	0.272
HoxM_U1	0.222	0.247	0.185	0.210	0.025	0.000	0.160	0.210	0.222	0.296
HoxM_Y	0.185	0.198	0.185	0.160	0.148	0.160	0.000	0.148	0.148	0.309
HoxM_W	0.235	0.235	0.247	0.185	0.198	0.210	0.148	0.000	0.148	0.259
HoxM_U2	0.210	0.210	0.235	0.185	0.210	0.222	0.148	0.148	0.000	0.272
HoxM_V	0.296	0.296	0.333	0.321	0.272	0.296	0.309	0.259	0.272	0.000

length = 81
threshold = 9

distance	Hox8_Z	Hox8_Y	Hox8_X	Hox8_W
Hox8_Z	0	18	20	23
Hox8_Y	18	0	11	18
Hox8_X	20	11	0	19
Hox8_W	23	18	19	0
relative
Hox8_Z	0.000	0.222	0.247	0.284
Hox8_Y	0.222	0.000	0.136	0.222
Hox8_X	0.247	0.136	0.000	0.235
Hox8_W	0.284	0.222	0.235	0.000

length = 81
threshold = 8

distance	Hox9_Z1	Hox9_Z2	Hox9_V	Hox9_Z3	Hox9_X	Hox9_W	Hox9_Z5	Hox9_Y	Hox9_Z4
Hox9_Z1	0	2	13	17	23	21	26	26	19
Hox9_Z2	2	0	15	19	25	23	28	28	21
Hox9_V	13	15	0	13	16	19	21	21	18
Hox9_Z3	17	19	13	0	24	19	22	22	15
Hox9_X	23	25	16	24	0	24	23	23	23
Hox9_W	21	23	19	19	24	0	31	31	23
Hox9_Z5	26	28	21	22	23	31	0	0	22
Hox9_Y	26	28	21	22	23	31	0	0	22
Hox9_Z4	19	21	18	15	23	23	22	22	0
relative
Hox9_Z1	0.000	0.025	0.160	0.210	0.284	0.259	0.321	0.321	0.235
Hox9_Z2	0.025	0.000	0.185	0.235	0.309	0.284	0.346	0.346	0.259
Hox9_V	0.160	0.185	0.000	0.160	0.198	0.235	0.259	0.259	0.222
Hox9_Z3	0.210	0.235	0.160	0.000	0.296	0.235	0.272	0.272	0.185
Hox9_X	0.284	0.309	0.198	0.296	0.000	0.296	0.284	0.284	0.284
Hox9_W	0.259	0.284	0.235	0.235	0.296	0.000	0.383	0.383	0.284
Hox9_Z5	0.321	0.346	0.259	0.272	0.284	0.383	0.000	0.000	0.272
Hox9_Y	0.321	0.346	0.259	0.272	0.284	0.383	0.000	0.000	0.272
Hox9_Z4	0.235	0.259	0.222	0.185	0.284	0.284	0.272	0.272	0.000

length=112
threshold = 11

distance	Hox9_Z1	Hox9_X	Hox9_W	Hox9_Y	Hox9_Z4
Hox9_Z1	0	29	27	33	24
Hox9_X	29	0	28	32	32
Hox9_W	27	28	0	38	31
Hox9_Y	33	32	38	0	30
Hox9_Z4	24	32	31	30	0
relative
Hox9_Z1	0.000	0.259	0.241	0.295	0.214
Hox9_X	0.259	0.000	0.250	0.286	0.286
Hox9_W	0.241	0.250	0.000	0.339	0.277
Hox9_Y	0.295	0.286	0.339	0.000	0.268
Hox9_Z4	0.214	0.286	0.277	0.268	0.000

length = 112
threshold = 12

distance	Hox10_Y1	Hox10_Y2	Hox10_W	Hox10_W2	Hox10_X	Hox10_Z
Hox10_Y1	0	4	24	24	22	26
Hox10_Y2	4	0	27	27	26	30
Hox10_W	24	27	0	15	15	24
Hox10_W2	24	27	15	0	16	24
Hox10_X	22	26	15	16	0	20
Hox10_Z	26	30	24	24	20	0
relative
Hox10_Y1	0.000	0.036	0.214	0.214	0.196	0.232
Hox10_Y2	0.036	0.000	0.241	0.241	0.232	0.268
Hox10_W	0.214	0.241	0.000	0.134	0.134	0.214
Hox10_W2	0.214	0.241	0.134	0.000	0.143	0.214
Hox10_X	0.196	0.232	0.134	0.143	0.000	0.179
Hox10_Z	0.232	0.268	0.214	0.214	0.179	0.000

length = 112
threshold = 8

distance	Hox11_Z	Hox11_Y	Hox11_X
Hox11_Z	0	31	31
Hox11_Y	31	0	27
Hox11_X	31	27	0
relative
Hox11_Z	0.000	0.277	0.277
Hox11_Y	0.277	0.000	0.241
Hox11_X	0.277	0.241	0.000

length = 112
threshold = 18